EcoSimulation — Приложения. Обозначения, используемые в моделях данного курса

 

Д.А. Шабанов
Конспект курса
"
Имитационное моделирование сложных биосистем
(с использованием LibreOffice Calc)
"

Приемы, используемые при создании моделей данного курса Обозначения, используемые в популяционно-экологических моделях данного курса Функции листа в Calc
Имитационное моделирование биосистем-Приложения Имитационное моделирование биосистем-Приложения Имитационное моделирование биосистем-Приложения

 

 

В популяционно-экологических моделях, которые создаются в данном курсе, используются перечисленные далее  обозначения. Те буквы латинского алфавита, которые используются в приведенном списке обозначений, выделены цветом: 
A a B b C c D d E e F f G g H h I i J j K k L l M m N n O o P p Q q R r S s T t U u V v W w X x Y y Z z.

Во многих случаях заглавная буква символизирует характеристику всей модельной популяции, а та же строчная — аналогичную характеристику какой-то группы. Так, of3 — плодовитость самок-трехлеток генотипа f, oF3 — плодовитость любых самок-трехлеток (если она одинакова для представителей разных генотипов), а O — общее количество потомков во всей модельной популяции. Впрочем, иногда заглавная и строчная буквы обозначают разные характеристики. Так, P — количество пар, а p — вероятность.

a — age — возраст.

nga — численность представителей с определенным генотипом и определенным возрастом.

mataf — возраст начала участия в нересте самок генотипа f

matam — возраст начала участия в нересте самцов генотипа m.

maxag — максимальная продолжительность жизни особей генотипа g.

bbreed — плодовитость самок, количество потомства, производимого самкой за один цикл размножения.

bf3 — плодовитость самок-трехлеток.

c — competitiveness — относительная конкурентоспособность. Задается вместо собственно конкурентоспособности c'ga, поскольку c'ga зависит от всего остального состава особей в местообитании. 

maxc' — максимальная конкурентоспособность, конкурентоспособность той группы особей, для которой вероятность выжить в ходе этапа конкурентного сокращения максимальна.

cga — относительная конкурентоспособность, отношение вероятности особи генотипа g a-того возраста пережить конкурентное сокращение численности к такой вероятности для наиболее конкурентоспособных особей: cga=c'ga / maxc'.

c'ga — конкурентоспособность, вероятность особи генотипа g и a-того возраста сохраниться после этапа конкурентного сокращения численности.

D — demand — потребность в ресурсах всей совокупности особей в модели. ωD = Σ(ωng× dga).

d — demand — потребность в ресурсах представителей определенной группы: dga.

e — effectiveness — коэффициент вероятности размножения самцов. Задается вместо собственно вероятности размножения, e'ma, которая зависит от всего остального состава особей в местообитании. 

maxe' — максимальная вероятность размножения, характерная для наиболее успешной в этом отношении группы самок.

ema — коэффициент вероятности размножения, отношение вероятности размножения самца генотипа m a-того возраста к такой вероятности для тех особей, у которых она максимальна: ema = e'ma / maxe'.

F — females — общая численность самок.

f — female — определенный женский генотип.

g — genotype — генотип. 

iinbound — количество особей, прибывающих в рассматриваемое местообитание, иммигрантов.

tiga — количество иммигрантов генотипа g a-того возраста, прибывающих на цикле t.

g — genotype — определенный генотип.

Hhermaphrodites — общая численность гермафродитов.

h — hermaphrodite — определенный гермафродитичный генотип.

K — емкость среды, количество особей, которые могут выжить в данном местообитании. 

l — loveliness — коэффициент вероятности размножения самок. Задается вместо собственно вероятности размножения, l'fa, которая зависит от всего остального состава особей в местообитании. 

maxl' — максимальная вероятность размножения, характерная для наиболее успешной в этом отношении группы самок.

lfa — коэффициент вероятности размножения, отношение вероятности размножения самки генотипа f a-того возраста к такой вероятности для тех особей, у которых она максимальна: lfa = l'fa / maxl'.

Mmales — общая численность самцов, принимающих участие в размножении.

mmale — определенный мужской генотип.

N — number — общая численность особей в популяции (гильдии etc). Если на разных этапах цикла модели численность изменяется, для обозначения численности на разных этапах используются буквы греческого алфавита: αN → βN → γN → δN → ε→ … → ωN. При этом αNg = Σ(αnga) и т.д.

n — number — численность определенной группы. nga — численность группы особей генотипа g (или иной категории) a-того возраста. nF2 — численность самок-двухлеток. Если на разных этапах цикла модели численность изменяется, для обозначения численности группы на разных этапах используются буквы греческого алфавита:  αngaβngaγngaδngaεnga → … → ωnga.

O — offspring — общее количество потомства за цикл размножения.

Og — количество потомков генотипа g.

o — offspring — доля потомков определенного генотипа у пар родителей с определенным генотипом.

og(f,m) доля потомков i-го генотипа у самки генотипа f и самца генотипа m.

Ppairs — количество пар.

r — reproduction — мальтузианский параметр, биотический потенциал.

s — survival — выживаемость. Описывает неконкурентную смертность.

sga — доля особей генотипа g a-того возраста, которая доживает до следующего шага моделирования. 

t — time — время; номер цикла модели.

αtnga — начальная численность представителей генотипа g a-того возраста на t-том цикле работы модели.

V — volume — общее количество ресурсов, доступных для модельной популяции.

wwad — доля икринок в кладке, которую способен оплодотворить самец.

wma — оплодотворительная способность самцв генотипа m a-того возраста.

X — обозначение женской половой хромосомы и генома, несущего такую хромосому.

Y — обозначение мужской половой хромосомы и генома, несущего такую хромосому.