EcoSimulation — Приложения. Обозначения, используемые в моделях данного курса

 

Д.А. Шабанов
Конспект курса
"
Имитационное моделирование сложных биосистем
(с использованием LibreOffice Calc)
"

Приемы, используемые при создании моделей данного курса Обозначения, используемые в популяционно-экологических моделях данного курса Функции листа в Calc
Имитационное моделирование биосистем-Приложения Имитационное моделирование биосистем-Приложения Имитационное моделирование биосистем-Приложения

 

 

В популяционно-экологических моделях, которые создаются в данном курсе, используются следующие обозначения.

Во многих случаях заглавная буква символизирует характеристику всей модельной популяции, а та же строчная — аналогичную характеристику какой-то группы. Так, b(f3— плодовитость самок-трехлеток, а B — общее количество потомков во всей модельной популяции. Впрочем, иногда заглавная и строчная буквы обозначают разные характеристики. Так, P — количество пар, а p — вероятность.

a — age — возраст; в обозначениях типа n(iga) — общее количество возрастов, рассматриваемых в модели.

mata(xf) — возраст начала участия в нересте самок x-того генотипа. 

mata(ym) — возраст начала участия в нересте самцов y-ового генотипа.

maxa(ig) — максимальная продолжительность жизни особей i-того генотипа.

Bbreed — общее количество потомства за цикл размножения. B(iG) — количество потомков i-того генотипа.

bbreed — плодовитость самок, количество потомства, производимого самкой за один цикл размножения. b(f3) — плодовитость самок-трехлеток.

c — competitiveness — относительная конкурентоспособность. Задается вместо собственно конкурентоспособности c'(iga), поскольку c'(igaзависит от всего остального состава особей в местообитании. 

c(iga) — относительная конкурентоспособность, отношение вероятности особи i-того генотипа и a-того возраста пережить конкурентное сокращение численности к такой вероятности для наиболее конкурентоспособных особей: c(iga)=c'(iga) / maxc'(iga).

c'(iga— конкурентоспособность, вероятность особи i-того генотипа и a-того возраста сохраниться после этапа конкурентного сокращения численности.

 maxc'(iga) — конкурентоспособность той группы особей, для которой вероятность выжить в ходе этапа конкурентного сокращения максимальна. 

D — demand — потребность в ресурсах всей совокупности особей в модели. ωD=Σ(ωn(iga)×d(iga)).

d — demand — потребность в ресурсах представителей определенной группы: d(iga).

F — females — общая численность самок.

f — female — самка или самки определенной группы.

xfa — представители x-того генотипа a-того возраста самок. 

G — genotype — группа, генотип. 

g — genotype — представители одной из групп.

iga — представители i-того генотипа a-того возраста.

Hhermaphrodites — общая численность гермафродитов.

h — hermaphrodite — гермафродит или гермафродиты определенной группы.

i — количество генотипов в модели. ii-тый генотип.

j  — количество разновидностей ресурсов в модели. jv — единица ресурса j-той категории.

K — емкость среды, количество особей, которые могут выжить в данном местообитании. 

l — loveliness — коэффициент вероятности размножения. Задается вместо собственно вероятности размножения, l'(iga), которая зависит от всего остального состава особей в местообитании. 

l(iga— коэффициент вероятности размножения, отношение вероятности размножения особи i-того генотипа и a-того возраста к такой вероятности для тех особей, у которых она максимальна: l(iga) = l'(iga) / maxl'(iga).

l'(iga) — вероятность размножения особей i-того генотипа и a-того возраста.

maxl'(iga) — максимальная вероятность размножения, характерная для наиболее успешной в этом отношении группы особей.

l(xfa) — коэффициент вероятности образования пары с подходящим партнером у самки x-того генотипа и a-того возраста;  l(xfa) =l '(xfa) / maxl'(xfa).

l(yma) — коэффициент вероятности образования пары с подходящей партнершой у самца y-ового генотипа и a-того возраста;  l(yma) = l'(yma) / maxl'(yma).

Mmales — общая численность самцов, принимающих участие в размножении.

mmale — самец или самцы определенной группы.

yma — представители y-ового генотипа a-того возраста самцов.

N — number — общая численность особей в популяции (гильдии etc). Если на разных этапах цикла модели численность изменяется, для обозначения численности на разных этапах используются буквы греческого алфавита: αN → βN → γN → δN → ε→ … → ωN. При этом α= Σ(d(iga)) и т.д.

n — number — численность определенной группы. n(iga) — численность группы особей i-того генотипа (или иной категории) a-того возраста. n(f2) — численность самок-двухлеток. Если на разных этапах цикла модели численность изменяется, для обозначения численности группы на разных этапах используются буквы греческого алфавита:  αn(iga)βn(iga)γn(iga)δn(iga)εn(iga→ … → ωn(iga).

inbn — inbound — количество особей, прибывающих в рассматриваемое местообитание, иммигрантов.

outn — outgoing — количество особей, покидающих рассматриваемое местообитание, эмигрантов.

nwn-тый потребитель ресурса из определенной группы.

O — offspting — доля потомков определенного генотипа у пар родителей с определенным генотипом. .

O(xf,ym,ig) доля потомков i-го генотипа у самки x-го генотипа и самца y-го генотипа.

Ppairs — количество пар.

pprobability вероятность. Вероятность получения N-тым потребителем ресурса единицы j-той категории ресурсов — p(Nw,jv).

`p — относительная вероятность. Например, относительная вероятность получения единицы ресурса (`p) равна частному от деления вероятности получения единицы ресурса данной особью на вероятность получения единицы ресурса той особью, для которой эта вероятность максимальна. Таким образом, относительная вероятность может изменяться от 0 до 1. 

R — resource — общее количество ресурсов, доступных для модельной популяции.

r — reproduction — мальтузианский параметр, биотический потенциал.

s — survival — выживаемость. Описывает неконкурентную смертность. s(iga) — доля особей i-того генотипа a-того возраста, которая доживает до следующего шага моделирования. 

t — time — время; номер цикла модели.

n(iga)t — численность представителей i-того генотипа a-того возраста на t-том цикле работы модели.

V — volume — общее потребление ресурсов всей совокупностью групп или индивидов.

vvariety — разновидность ресурсов. jv — единица ресурса j-той категории.

wworthy — особа, потребитель ресурса. nwn-тый потребитель ресурса из определенной группы; NwN-тый потребитель ресурса из модельной популяции.

X — обозначение женской половой хромосомы.

x — количество генотипов самок; xf — самка x-того генотипа.

Y — обозначение мужской половой хромосомы.

y — количество генотипов самцов; ym — самец y-ового генотипа.
 

Те буквы латинского алфавита, которые используются в приведенном списке обозначений, выделены цветом: 
A a B b C c D d E e F f G g H h I i J j K k L l M m N n O o P p Q q R r S s T t U u V v W w X x Y y Z z