|
Назва дисципліни
|
Еволюція сексу і статевих стратегій: імітаційне моделювання на R
|
|
Викладач
|
Шабанов Дмитро Андрійович, д.б.н., проф., професор кафедри зоології та екології тварин, shabanov@karazin.ua
http://batrachos.com/Sex_on_R
|
|
Курс та семестр, у якому планується вивчення дисципліни
|
II та IІІ курси; весняний семестр (IV та VI); курс доступний для здобувачів 2-го та 3-го рівнів вищої освіти (магістрів та аспірантів)
|
|
Факультети (навчально-наукові інститути), студентам яких пропонується вивчати дисципліну
|
Усі факультети та навчально-наукові інститути
|
|
Перелік компетентностей та відповідних результатів навчання, що забезпечує дисципліна
|
Здатність будувати імітаційні моделі на R (програма-максимум) та розуміти принципи їх роботи (програма-мінімум).
Знайомство з головними проблемами, що стосуються статевого розмноження та статевих стратегій, а також з гіпотезами, що висунуті для їх рішення
|
|
Опис дисципліни
|
|
Попередні умови, необхідні для вивчення дисципліни
|
Критично необхідних умов нема. Студенти, що незнайомі з програмуванням на R, засвоять його основи протягом курсу
|
|
Максимальна кількість студентів, які можуть одночасно навчатися
|
25
|
|
Теми аудиторних занять та самостійної роботи
|
Розділ 1. Основні концепції та інструменти курсу
-
Сутність моделювання. Пізнання як моделювання. Види моделей. Способи моделювання. Чому усі моделі неправильні, але деякі з них корисні. Мова R як інструмент для імітаційного моделювання. Інсталяція R та RStudio.
-
Природний добір. Дарвінівське (біологічне) та больцманівське (найширше) розуміння природного добору. Відсутність передбачення у дії дарвінівського добору. Приклад R-моделі дії добору на модельну популяцію.
-
Основи роботи з R та RStudio. Організація спільної роботи з R-моделями у мережі. Організація імітаційної моделі на R. Цикли імітації. Недетерміновані моделі; використання ітерацій для оцінки розподілу ймовірностей різних результатів моделювання.
-
Історично обумовлені системи: результати та жертви своєї історії. Неможливість їх розуміння без врахування їх траєкторії становлення. Рівновага Парето та рівновага Неша. Моделювання “пастки Неша” на R.
-
Проблема рівнів добору. Сценарії Невидимої Руки, Невидимої ноги та Невидимої Голови. Поняття стратегії. Приклади моделювання дворівневого добору та різниці стратегій на R.
Розділ 2. “Королева еволюційних проблем” — сексуальне відтворення
-
Відтворення без рекомбінації. Храповик Мюлера і його імітаційне моделювання на R. “Стеля складності” клонально відтворюваних геномів. Типи рекомбінації. “Підйом стелі складності” завдяки рекомбінації, його моделювання на R.
-
Гіпотези, що пояснюють походження та стійкість статевого відтворення, моделювання передбачених ними механізмами на R. Перехід від ізогамії до оогамії. Гіпотеза Паркера. Моделювання на R.
-
Чому статей дві? Обговорення і моделювання гіпотетичної системи відтворення з трьома статями. Переваги диференціації статей та еволюційна теорія статі Геодакяна. Перехід від популяції гермафродитів з перехресним заплідненням до роздільностатевої популяції.
-
Дилема Голдейна, та її імітаційне моделювання на R. Сокира Кондрашова як розв’язання дилеми Голдейна.
Розділ 3. Конфлікт статей і різноманіття статевих стратегій у людини
-
“Війна статей” та її моделювання. Правило Бейтмана та його критика. Геномний імпринтинг. Концепція еволюції еволюції.
-
Еволюційне становлення особливостей жіночого репродуктивного циклу людини: прихованої овуляції, клімаксу. Зв’язок цих особливостей з пристосуванням до культурного спадкування. R-моделювання.
-
Утворювати постійну пару чи користуватися сприятливими можливостями? Подружня вірність або адюльтер? Базові та альтернативні статеві стратегії, їх моделювання.
-
Парадокс облігатної гомосексуальності. Чому облігатні гомосексуали, які не лишають нащадків, з’являються у кожному поколінні з достатньо високою частотою? Можливі пояснення парадокса та їх моделювання.
-
Як можна використати результати спільної роботи викладачів та студентів протягом курсу? Обговорення ідей та планів.
|
|
Мова викладання.
|
Українська
|
