Здесь представлена система рептилий, соответствующая следующему изданию: 
М.Ф. Ивахненко, Е.Н. Курочкин (ответственные редакторы). Ископаемые позвоночные России и сопредельных стран. Ископаемые рептилии и птицы. Часть 1. Справочник для палеонтологов, биологов и геологов. - М.: ГЕОС, 2008. - 348 с.

Класс Reptilia

(представлены только ископаемые таксоны, известные с территории России и сопредельных стран)

 

Подкласс Parareptilia

          Надотряд Procolophonomorpha

               Отряд Procolophonida

                    Подотряд Nyctiphruretia

                    Подотряд Procolophonia

          Надотряд Cheloniamorpha

               Отряд Pareiasaurida

                    Подотряд Nycteroleterina

                    Подотряд Pareiasaurina

Подкласс Captorhinomorpha

               Отряд Captorhinida

               Отряд Bolosaurida

Подкласс Ophiacomorpha

               Отряд Ophiacodontia

               Отряд Casesauria

Подкласс Theromorpha

     Инфракласс Eotherapsida

          Надотряд Dinomorpha

               Отряд Gorgodontia

                    Подотряд Dinocephalia

                         Инфраотряд Tapinocephalida

                         Инфраотряд Titanosuchida

                    Подотряд Gorgonopia

                         Инфраотряд Nikkasaurida

                         Инфраотряд Gorgonopida

                         Инфраотряд Estemmenosuchida

               Отряд Anomodontia

                    Подотряд Ulemicia

                    Подотряд Dicynodontia

                         Инфраотряд Dromasaurida

                         Инфраотряд Dicynodontida

     Инфракласс Therosauria 

               Отряд Therocephalia

                    Подотряд Pristerosaurida

                    Подотряд Scaloposaurida

               Отряд Cynodontia

                    Подотряд Procynosuchia

                    Подотряд Cynognathia

Подкласс Synaptosauria

          Надотряд Araeoscelomorpha

               Отряд Araeoscelidia

               Отряд Trilophosauria

          Надотряд Sauropterygiomorpha

               Отряд Sauropterygia

                    Подотряд Eosauropterygia

                    Подотряд Plesiosauria

               Отряд Placodontia

Подкласс Ichthyopterygia

               Отряд Ichthyosauria

                    Подотряд Ichthyosauroidei

Подкласс Lepidosauromorpha

     Инфракласс Lepidosauria

          Надотряд Squamata

               Отряд Eolacertilia

Подкласс Archosauromorpha

     Инфракласс Proarchosauria

          Надотряд Eosuchia

               Отряд Rhynchocephalia

          Надотряд Prolacertilia

               Отряд Prolacertiformes

                    Подотряд Protorosauria

                    Подотряд Sharovipterygia

               Отряд Megalancosauria

                    Подотряд Longisquamia

     Инфракласс Archosauria

          Надотряд Suchia

               Отряд Thecodontia

                    Подотряд Proterosuchia

                         Инфраотряд Erythrosuchia

                    Подотряд Pseudosuchia

                         Инфраотряд Rauisuchia

                    Подотряд Ornithosuchia

                         Инфраотряд Euparkeriidia

          Надотряд Pterosauria

               Отряд Rhamphorhynchida

               Отряд Pterodactylida