Екологія: біологія взаємодії. I-18. (доповнення) Рівні добору

Різні рівні біосистем суттєво відрізняються за своїми властивостями. Одна з поширених помилок полягає в очікуванні, що на усіх рівнях добір буде йти однаково на різних рівнях. Якщо на рівні особин добір йде через загибель одних одиниць та розмноженні — інших, то дехто очікує, що на біосферному рівні добір буде йти таким саме чином. Насправді це необов'язково. Добір sensu lato на рівні біосфери може не бути дарвіновським, він може виглядати як оптимізація.  

Екологія: біологія взаємодії. I-19. (доповнення) Сценарії дворівневого добору: Невидима рука, Невидима нога, Невидима голова

Ми використовуватимемо поняття Невидима рука (©Adam Smith) для випадків узгодженості оптимізації на вищому на нижчому рівнях.
У разі суперечності між рівнями ми будемо казати про  Невидиму ногу (©Herman Daly) у разі перемоги нижчого рівня та Невидиму голову у разі перемоги вищого рівня.
У яких випадках в біологічних, соціальних системах тощо реалізується сценарій Невидимої голови?

 

Парадокси сексуального розмноження: Виступ на KarazinBioHub

18 липня 2024 року у межах KarazinBioHub автор цього сайту прочитав лекцію про парадокси сексуального розмноження. Як завжди, цей виступ транслювався на YouTube-каналі біологічного факультету ХНУ імені В. Н. Каразіна.

Відеозапис цього виступу та презентація, що була використана в ньому, доступні й на цій сторінці. В цьому виступі використані матеріали курсу «Еволюція сексу і статевих стратегій: імітаційне моделювання на R». В матеріалах курсу теми, що були згадані в виступі, розглянуті детальніше.

Моделі в біології та можлива користь від них: Виступ на KarazinBioHub

13 червня 2024 року у межах KarazinBioHub автор цього сайту прочитав лекцію про імітаційне моделювання в біології. Як завжди, цей виступ транслювався на YouTube-каналі біологічного факультету ХНУ імені В. Н. Каразіна.

Відеозапис цього виступу та презентація, що була використана в ньому, доступні й на цій сторінці. Назва виступу «Моделі в біології та можлива користь від них» пов'язана з глибоким висловом Джорджа Бокса «Усі моделі хибні, але деякі з них корисні». З обговорення цієї думки починається доповідь, і у її ході довелося багато разів повертатися до цього мудрого афоризму.

«Ситість, секс, статус: еволюційно обумовлені механізми поведінки людини та інших тварин»: анотація курсу

Анотація міжфакультетської дисципліни за вибором

«СИТІСТЬ, СЕКС, СТАТУС: ЕВОЛЮЦІЙНО ОБУМОВЛЕНІ МЕХАНІЗМИ ПОВЕДІНКИ ЛЮДИНИ ТА ІНШИХ ТВАРИН»

StatOracle–04 Перше знайомство з використанням R

У цьому розділі почате знайомство з використанням R і наведено кілька простих прикладів дій, що необхідні для аналізу біологічних даних.

Sustainable use of fisheries resources. Variant IIb. Simulation model in R

Ті ж самі речі можна пояснювати різним чином. Тут розміщено опис імітаційної моделі, створеної засобами R, робота з якою познайомить з  проблемою забезпечення стійкості рибних запасів. Інший спосіб пояснення тієї ж теми — тут і тут

Екологія: біологія взаємодії. I-16. (доповнення) Чому світ саме такий, який він є? Сила еволюційно-екологічного підходу

Наведемо приклад застосування еколого-еволюційного підходу для розуміння того, чому організми є такими, якими ми їх спостерігаємо. Ключ до пояснення властивостей будь-якої біосистеми лежить у розгляді особливостей її стосунків з середовищем протягом її історії. Чому людина має дві руки та дві ноги, а не нагадує кентавра? Тому що вона є прямоходячим представником групи (надкласу) Tetrapoda — Чотириногі. До тетрапод належать наземні (та вторинноводні) хребетні. Чому хребетні, які вийшли на суходіл, зробили це саме на чотирьох (а не, припустимо, на шести, як комахи) ногах? Докладна відповідь на це питання потребує багато місця, але коротко викласти її логіку можна і тут.

 

Екологія: біологія взаємодії. I-09. Моделювання як пізнання — і біосистем, і усього іншого

Імітаційну модель можна розлядати як сукупність розрахункових величин та правил їх перерахунку. Звісно, створюючи модель, слід передбачити «вхід» (опис початкового стану модельованої системи, вхідні параметри та умови експерименту з моделлю) та «вихід» (засоби інтеграції отриманих результатів та їх презентації). Які задачі можна вирішувати за допомогою імітаційного моделювання? Прогнозування динаміки певного процесу на підставі наявних даних. Пошук суперечностей в уявленнях про об'єкт дослідження. Вдосконалення таких уявлень тощо. Один з цікавих типів імітаційних моделей може перевіряти, чи достатньо певного набору причин, щоб викликати у досліджуваної системи властивості, походження яких намагається зрозуміти дослідник. Якщо модель, при побудові якої задано чітко визначений набір факторів, демонструє ознаку, яка досліджується, це доводить, що ця ознака може бути наслідком даного набору факторів.